大蔥、洋蔥、韭菜這三個種子的表皮顏色都是黑色的，形狀也相似，若不仔細看，很難辨別，但仔細觀察，三者之間仍有差異。

大蔥種子呈盾狀，有棱角，稍扁平，表皮皺紋少而整齊，臍部凹洼淺。洋蔥種子呈盾狀，表皮皺紋稍多而不規則，臍部凹洼很深。韭菜種子呈盾狀，表皮皺紋多而細密，臍部無明顯的凹洼。再者，一般大蔥種子的千粒重為2．8--2．9克之間，洋蔥種子的千粒重為4．6克左右，韭菜種子的千粒重為4--4．15克，用手掂起來感覺一下，大蔥種子較輕，洋蔥種子較重。其三，這三種蔬菜種子的種皮透水性差，吸水膨脹緩慢，播種前要進行浸泡，且這三種蔬菜種子的壽命較短，種植播種時不要用陳種子。