每年在棉花生產上最易引起糾紛的問題之一，就是棉種發芽率的高低。發芽率達到或者超過80%的，農民朋友就很贊賞。為什么有些棉種的發芽率不高呢？一是有些制種的棉田偏施了氮素肥料，棉花個體營養生長較旺，棉田蔭蔽較大，棉花吐絮不暢，棉種成熟度較差；二是在制種的大田，采收了尚未完全成熟的帶殼棉桃，帶回家中剝出棉花。這是棉種發芽率不高的主要原因。當然，除此以外，還有一些人為因素影響棉種的發芽率，一是收購部門收了些含水量較大的“人情花”，棉種的含水量也相對較高；二是作種用的棉花沒有嚴格分級收花，有些等外級的嫩籽棉花也入了倉庫；三是棉種剝絨時，破籽率超標；四是包衣棉種中殘酸量較高。
     
　　據了解，有些農民喜歡偏施氮素肥料，一是施用氮素肥料后，棉花生育速度較快；二是氮素肥料比較便宜；三是認為棉花營養株體大產量就會高。又據調查，農民采收剝桃花的理由，一是怕別人在田間偷摘棉花；二是白天摘花溫度高，體力消耗大，把棉桃帶殼摘回家，溫度低，全家都可幫忙剝花；三是剝桃花水分含量高一些，可以多賣濕花，以少賣多。
     
　　不良種子花比重的增加，已經形成了對棉種質量和纖維品質的一大公害。據有關科研部門測定，完熟的棉花種子發芽率為95．5%，成熟的棉種發芽率為92%，半成熟的棉種發芽率為63%，未成熟的棉種發芽率只有14%。同時，不良種子花的纖維品級、長度、強度、轉曲度等質量指標，比成熟的棉花纖維大為下降。因此，一定要將不良種子花拒之于種子花的收購之外。
　　
　　棉種質量的好壞，事關棉花生產全局，選準用好優良的棉種，可為棉花高產打下良好的基礎。為提高種子花的收購質量，各地應采取一些嚴厲有效的激勵措施。
　　
　　首先，要界定優良品種范圍，制定良種優惠價格政策。無論雜交棉制種或者常規棉制種，一要選定采收棉花良種的村組、面積；二要明確良種收購數量；三要提高優良優質品種的價格含金量，調動農民交售優質種花的積極性。
　　
　　其次，要選擇穩健生長棉株，選摘中期大朵種花。避免在偏施氮肥、蔭蔽較大的棉田選種。要總結偏施氮肥的教訓，搞好配方施肥，增施有機肥和鉀肥，提高種花質量。
　　
　　第三，要嚴格分級收花，拒收剝桃花作種花。堅持收購4級以上高純度的干籽花作種，拒收含水量高的“人情花”作種。等外花、秋后花只能作商品花收購，決不能作種花使用。
　　
　　第四，要嚴把加工種花質量，嚴控破籽率，降低殘酸含量。淘汰剝絨、包衣中出現的劣質種子。