大棚韭菜一般采取移栽方式種植，可以在移栽后選用二甲戊靈、撲草凈、仲丁靈進行土壤封閉處理。每畝用施用補330克/升乳油150毫升或48%仲丁靈乳油200-250毫升，加水50公斤噴霧，可以防除多種禾本科雜草和部分闊葉雜草，對韭菜較安全。每畝用50%撲草凈可濕性粉劑100-150克噴霧，可以防除多種闊葉雜草。沙土、沙壤土上最好不要使用撲草凈，以防多次灌溉后藥物淋溶到韭菜根部造成藥害。

    老根韭菜的抗藥性較強，除上述藥劑外，還可以選用氟樂靈、乙氧氟草醚等藥劑防除雜草。看麥娘等禾本科雜草較多的田塊，可以每畝用48%氟樂靈乳油100-150毫升噴霧。為避免對韭菜生長產生影響，盡量定向噴霧，避免藥液接觸韭菜。氟樂靈易揮發和光解失效，噴施后中耕混土1-3厘米。對禾本科雜草與闊葉雜草、莎草混生的田塊，可以每畝用果爾24%乙氧氟草醚乳油50-60毫升噴霧。用乙氧氟草醚化除，韭菜出土后葉尖會出現褐色斑點，幾天后藥斑可自燃消失。這些藥劑均為土壤封閉處理劑，對大齡草防效差，應先人工拔除大草。老根韭菜田一般割一刀就要噴施一次除草劑，掌握在傷口愈合后施藥。在傷口沒有愈合時施藥，藥劑從傷口進入，很容易出現藥害。如撲草凈在傷口未愈合時使用，會抑制韭菜的光合作用，減少上市次數，同時使葉片變窄，質量下降。

    噴施氟樂靈等除草劑后，應注意大棚的通風換氣，否則揮發出的除草劑濃度過大，或者藥物溶入棚膜上的水中，隨水滴到新生韭菜葉片上，容易對韭菜產生藥害。

    韭菜生長期田間有禾本科雜草發生時，可以用精喹禾靈、高效氟吡甲禾靈等藥防除；禾本科雜草和闊葉草混合發生時，如果草齡較小，噴施乙氧氟草醚有較好的除草效果，但容易在韭菜葉片上產生灼傷斑，影響外觀。

    草害嚴重，特別是宿根性惡性闊葉雜草、莎草發生比較嚴重時，如果韭菜已有一定的生長量，可以考慮先挑割韭菜（雜草不割）,用干凈圖適當覆蓋割茬，然后噴施使它隆200克/升氯氟吡氧乙酸乳油或滅草松，防除田間的惡性闊葉雜草、莎草。其中氯氟吡氧乙酸對闊葉雜草防效好，滅草松對莎草防效好。這兩種藥對韭菜均可能產生一定的藥害，最好不要在韭菜生長期長期直接噴施。大面積施藥前應先小面積試驗，成功后再擴大面積。